1．肺不張

肺不張是由支氣管或細支氣管被黏稠分泌物部分堵塞，多見于肺中葉和下葉，可能與中葉分泌物引流不暢有關(guān)。

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2．支氣管肺炎

為最常見的并發(fā)癥，多為繼發(fā)感染所致，可發(fā)生在病程中任何時期，但以痙咳期多見。發(fā)生支氣管肺炎時，陣發(fā)性痙咳可暫時消失，而體溫突然升高，呼吸淺而快，口唇發(fā)紺，肺部出現(xiàn)啰音，外周血白細胞升高，以中性粒細胞升高為主，X線胸片檢查可見肺炎病變。

3．百日咳腦病

這是最嚴重的并發(fā)癥，發(fā)生率2%～3%，主要發(fā)生于痙咳期，表現(xiàn)為反復(fù)抽搐，意識障礙，高熱，甚至出現(xiàn)腦水腫、腦疝而危及生命。發(fā)生機制是由于痙咳而引起腦血管痙攣，導(dǎo)致腦缺氧，腦出血所致。

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4．肺氣腫及皮下氣腫

由于痙咳及分泌物阻塞，可導(dǎo)致肺氣腫，當(dāng)肺泡高壓，肺泡破裂可引起肺間質(zhì)氣腫，通過氣管筋膜下產(chǎn)生頸部皮下氣腫，通過肺門可引起縱隔氣腫，通過胸膜臟層可產(chǎn)生氣胸。