陳修園的時(shí)代，一般醫(yī)生為了應(yīng)付門診，多半只學(xué)習(xí)唐、宋以來各個(gè)醫(yī)家的藥書、方書，想從中找出幾個(gè)治病的藥方，而對(duì)祖國的醫(yī)學(xué)經(jīng)典著作、理論著作和《內(nèi)經(jīng)》、《難經(jīng)》、《神農(nóng)本草經(jīng)》以及《傷寒論》、《金匱要略》等到著作并不感興趣。更不愿為研究這些著作而下苦功夫。

陳修園感到這股輕視中醫(yī)基本理論的風(fēng)氣是不正常的。為了扭轉(zhuǎn)這股學(xué)氣，嘉慶二十四年(1819年)，陳修園告老還鄉(xiāng)，在福建省嵩山井上草堂講學(xué)，不但把他數(shù)十年來研究這幾部中醫(yī)經(jīng)典的體會(huì)傳授給學(xué)生，而目，大力呼吁其他醫(yī)學(xué)家也應(yīng)對(duì)這方面的學(xué)習(xí)加以重視。聽他講課的人很多，來自全國許多地方。

不成規(guī)矩就不成方圓，陳修圓宗于《內(nèi)經(jīng)》、《傷寒》等經(jīng)典著作，他對(duì)古典醫(yī)籍的鉆研功力深厚，涉獵廣泛，因此他的書籍正統(tǒng)，規(guī)范。他還長期從事中醫(yī)的普及工作，將中醫(yī)知識(shí)通俗化，為后學(xué)開啟了登堂入室之門。

在醫(yī)學(xué)理論上陳修園特別推崇張仲景，是維護(hù)傷寒派的中堅(jiān)人物之一，也是繼張志聰、張錫駒之后最有影響的尊經(jīng)崇古派。在傷寒研究的爭論中，他極力反對(duì)方有執(zhí)、喻嘉言的“錯(cuò)簡”說，認(rèn)為王叔和重新編注的《傷寒論》已經(jīng)把張仲景的學(xué)說完整地流傳下來，不能隨便改動(dòng)和取舍。他在研究《傷寒論》、《金匱要略》方面的代表著作有《傷寒論淺注》、《金匱要略淺注》和《傷寒醫(yī)訣串解》，前兩書曾三易其稿，史書稱其“多有發(fā)明，世稱善本”。他還將《傷寒論》、《金匱要略》兩書中的方劑和治法編成《長沙方歌括》、《傷寒真方歌括》與《金匱方歌括》，易于記憶、習(xí)誦，對(duì)后學(xué)理解《傷寒論》、《金匱要略》很有幫助。雖然有人說陳修園注疏古籍有獨(dú)到之處，但他上述著作的廣泛流傳主要是因?yàn)樗难芯烤哂猩钊霚\出的特點(diǎn)，為后學(xué)者、特別是初學(xué)者研究張仲景典籍提供了入門的階梯。

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在臨床治療上，陳修園長于用溫補(bǔ)脾腎的方法治療雜病，不喜用寒涼滋陰的藥物。如他自己所說：“寒涼之藥不可久服，人人俱知也，唯滋陰降火及不涼不溫之品，最是誤人。余素不喜寒涼，姑以寒涼方之不可棄者列”。他雖然承認(rèn)滋腎丸、四生丸、清燥救肺湯等寒涼方劑能培補(bǔ)生氣，是治療“癆門”(肺結(jié)核一類消耗性疾病)不可少之方，但也只能暫用。而對(duì)保元方、六君子湯、五味異功散、歸脾湯、附子理中湯等溫?zé)岱絼﹦t大贊其“補(bǔ)虛退熱，進(jìn)食除疾”、“益精氣，扶元?dú)狻钡墓π?，有“補(bǔ)火以致水之妙”。