早在在蘇聯(lián)境內(nèi)作戰(zhàn)時，希特勒便提出過“城市堡壘”的概念，即即使身陷重圍，德軍仍要把守主要城市和交通樞紐，這一次德軍統(tǒng)帥部使柯尼斯堡在完全孤立的條件下做好了長期防御的準備。 市內(nèi)有地下工廠、兵工廠和倉庫。要塞的防御體系，由外層防御圍郭(在1月份幾次戰(zhàn)斗中已被蘇軍突破)和三道陣地組成。

第一道陣地距市中心6—8公里，包括2—7條有交通壕的塹壕和大量防坦克障礙物、15個舊堡壘及其他防御工事。

第二道陣地構(gòu)筑于市郊，由適于防御的磚石建筑物、設(shè)置于交叉路口的街壘以及永備發(fā)射點和布雷地段組成。

第三道陣地沿舊城界構(gòu)筑，依托9個老式堡壘。守衛(wèi)柯尼斯堡的有4個步兵師、若干國民沖鋒隊獨立團和獨立營。其編成內(nèi)共約13萬人、近4000門火炮和迫擊炮、108輛坦克和強擊火炮。蘇軍人數(shù)與德軍大致相等，但火炮比德軍多0.3倍，坦克和自行火炮多4倍，航空兵多13倍。 在開始強攻柯尼斯堡前，方面軍炮兵在紅旗波羅的海艦隊所屬鐵道炮兵參加下，四天內(nèi)對德軍永備發(fā)射工事進行了破壞。在此期間，航空兵由于天氣不適于飛行而未行動。

1945年4月6日，白俄羅斯第3方面軍在進行一個半小時炮火準備并實施航空兵突擊后發(fā)起進攻。德軍進行了頑強抵抗。但蘇軍勇猛前進。至日終前，第39集團軍已楔入德軍防御4公里，并切斷了柯尼斯堡—皮勞鐵路。第43、第50集團軍和近衛(wèi)第11集團軍突破了第一道陣地，直逼市區(qū)。第43集團軍部隊首先突入柯尼斯堡。隨后幾天，進攻加快速度進行。天氣的明顯好轉(zhuǎn)使航空兵能夠全力出動。

4月7日晝間，該市西南區(qū)和西區(qū)遭到了密集的空中突擊，德軍在這兩處扼守一條溝通柯尼斯堡守軍與澤姆蘭半島軍隊聯(lián)系的狹小走廊。蘇軍航空兵在一天的戰(zhàn)斗中共出動4758架次，向德軍投擲了1658噸炸彈。至4月8日日終前，蘇軍攻占了該市港口、鐵路樞紐和許多軍工目標，割斷了要塞守軍與澤姆蘭半島軍隊的聯(lián)系。這天，蘇軍統(tǒng)帥部派出軍使敦促守軍放下武器。但德軍繼續(xù)抵抗。

4月9日晨，第43集團軍打破了守軍一些部隊西逃企圖。德軍坦克第5師由澤姆蘭半島向柯尼斯堡實施的相向突擊也未得逞。在蘇軍炮兵和大約1500架飛機對殘存的抵抗樞紐部進行密集突擊之后，近衛(wèi)第11集團軍對市中心的德軍發(fā)起沖擊，于4月9日21時迫使要塞守軍投降。

柯尼斯堡戰(zhàn)役，共消滅德軍官兵約4.2萬人;俘獲約9.2萬人，其中軍官 和將軍近1800名;迫擊炮1652門、飛機128架。為紀念柯尼斯堡戰(zhàn)役設(shè)立了攻克柯尼斯堡獎?wù)?，總共授予約76萬人攻克這枚獎?wù)?。約200名軍人被授予蘇聯(lián)英雄稱號。