乾隆二十三年八月，定邊將軍兆惠奉命由伊犁(今新疆伊寧)率部南下，指揮清軍平定回部大、小和卓叛亂。兆惠遣副將富德駐阿克蘇，為第二梯隊(duì)，自率馬步兵4000余往攻小和卓霍集占所在的葉爾羌城(今新疆莎車)。葉爾羌城周十余里，城門12座?；乇谇遘姳亟?jīng)的城東5里處，挖溝筑臺(tái)，以為屏障;并實(shí)行堅(jiān)壁清野。十月初三日，兆惠所部抵輝齊阿里克，距葉爾羌城40里，隔河扎營，并派出左、右兩翼兵，搶占了城東土臺(tái)，控制進(jìn)出要道。初六日，東、西、北三座城門中沖出數(shù)百名騎兵，兩軍廝殺，回兵三戰(zhàn)皆敗，遂退回城中固守。

兆惠大營安扎于黑水河畔，故名“黑水營”。兆惠見葉爾羌城防守嚴(yán)密，便撥出800人清軍交副都統(tǒng)愛隆阿，命其前往東南方向，防御盤踞在喀什噶爾(今新疆喀什)的大和卓叛軍，其余兵力密切監(jiān)視葉爾羌城，待機(jī)再戰(zhàn)。時(shí)獲情報(bào)，言城南山下有回人牧群。兆惠決定往劫羊群，以補(bǔ)充給養(yǎng)，并誘敵出城作戰(zhàn)。十三日，兆惠率干余騎兵南進(jìn)。前面有河，清軍奪占橋頭，登橋而馳。豈料剛過橋400余人，橋驟斷，葉爾羌城中隨即沖出叛軍5000騎兵、1萬步兵，張開兩翼攻圍清軍。清軍人自為戰(zhàn)，浮水還營，兆惠兩易戰(zhàn)馬，面脛俱傷。直至夜晚，回兵方退回城中。清軍亡100余人，傷數(shù)百人，總兵高天喜戰(zhàn)死。

十四日，霍集占組織回兵向黑水營發(fā)動(dòng)猛攻。兆惠指揮士卒邊戰(zhàn)邊筑起臨時(shí)工事。戰(zhàn)斗持續(xù)了整整5天。兆惠派出5名士兵，分別往阿克蘇告急，駐阿克蘇頭等侍衛(wèi)舒赫德飛章奏報(bào)朝廷。乾隆帝命靖逆將軍納木札爾往援。防御喀什噶爾的副都統(tǒng)愛隆阿奉兆惠之命，返阿克蘇催促援軍，途遇納木札爾所率200名騎兵，愛隆阿勸其待大兵到后再進(jìn)，納木札爾未從，后于途中全軍覆沒?；艏家姀?qiáng)攻不下，便改為長期圍困。黑水營自十月至次年正月，進(jìn)行了艱苦的防御戰(zhàn)。時(shí)天寒地凍，彈盡糧絕，援兵不至，無險(xiǎn)可依?；乇谏嫌螞Q河灌營，清軍在下游挖溝泄水?；乇鴺審椚缬?，清軍砍掉林木，由樹干中挖出數(shù)萬顆彈丸。后清軍挖水井，掘窖糧，補(bǔ)充了給養(yǎng)。

十一月間，回疆以西的布魯特人搶掠了喀什噶爾所屬英吉沙爾城(今新疆英吉沙)，恰好黑水營清軍縱火焚燒兩座回營。霍集占以為清軍與布魯特人有約，懼被夾擊，故攻黑水營稍懈。黑水營艱難持守之時(shí)，清廷急調(diào)援兵增援。駐阿克蘇的定邊右副將軍富德與侍衛(wèi)舒赫德于巴爾楚克(今新疆巴楚)合軍，共率3000余兵，冒雪赴援。巴里坤辦事大臣阿里袞領(lǐng)兵600，解馬2000匹、駱駝1000頭，兼程來援，與愛隆阿所部會(huì)合。

二十四年(1759年)正月初六日，富德、舒赫德所部于呼爾埔，遇由葉爾羌城而來之5000叛軍，廝殺4日，清軍且戰(zhàn)且進(jìn)。初九日，富德、舒赫德部已接近黑水營，被叛軍所圍，處境危險(xiǎn)。阿里袞、愛隆阿率部趕到，拉開橫陣，大呼馳進(jìn)，兩軍會(huì)合作戰(zhàn)，叛軍退往葉爾羌。兆惠于黑水營中知援兵已到，立即組織所部突破包圍，殺敵千余，盡焚其壘。叛軍大敗;退回葉爾羌城。十四日，兆惠軍與援軍會(huì)師，撤還阿克蘇。