結(jié)果使農(nóng)田當中的害蟲幾乎沒有天敵，而讓次年的糧食嚴重歉收，發(fā)生極為嚴重的饑荒問題。不久后，包括鄭作新在內(nèi)的很多鳥類學者通過野外研究，證實了在麻雀的食譜中，人工種植的谷物僅占不到50%的比重，他們的研究成果甚至發(fā)表在中共中央的機關(guān)報《人民日報》上，這是絕無僅有的。

他們強烈的反對意見終于得到了中科院的支持，1959年11月27日，中國科學院黨組書記張勁夫，綜合生物學界的意見，寫了一份“關(guān)于麻雀問題向主席的報告”，并經(jīng)胡喬木轉(zhuǎn)報毛澤東。這份附有大量科學依據(jù)和分析的報告終于打動了毛澤東。

毛澤東在1960年3月18日他起草的《中共中央關(guān)于衛(wèi)生工作的指示》中明確提出：“麻雀不要打了，代之以臭蟲，口號是‘除掉老鼠、臭蟲、蒼蠅、蚊子’?！敝链?，科學家們不屈不撓地要求為麻雀“平反”的目的已經(jīng)達到，或者更加直捷地說吧，毛澤東已經(jīng)承認了他當初提出的消滅麻雀的錯誤，并親自為麻雀平了反。

不過，同年4月6日，某領(lǐng)導在二屆人大二次會議上所作的關(guān)于農(nóng)業(yè)問題上的報告中，對這一問題的“說法”又十分委婉：“麻雀已經(jīng)打得差不多了，糧食逐年增產(chǎn)了，麻雀對糧食生產(chǎn)的危害已經(jīng)大大減輕;同時林木果樹的面積大大發(fā)展了，麻雀是林木果樹的天敵。因此，以后不要再打麻雀了。”

4月19日，這一包含修正后“除四害”的《農(nóng)業(yè)發(fā)展綱要》四十條，正式提請 中華人民共和國第二屆全國人民人民代表大會第二次會議討論通過，向全國公布。從“承受不起麻雀造成的糧食損失而轟麻雀”到“全面權(quán)衡利弊、寧可遭受糧食損失也要容忍麻雀” ，最后還是肯定了麻雀的作用，改變了“轟麻雀”的做法。