秦瓊與程咬金兩人關(guān)系比較好，并且都是“不恥王世充奸詐的為人”，轉(zhuǎn)而投奔了唐高祖李淵，并且在李淵的命令之下，在李世民府上擔(dān)任軍職。在王世充麾下時，秦瓊為龍驤大將軍，程咬金為將軍，可見秦瓊的官職在程咬金之上。在兩人來到李世民麾下后，因?yàn)閮扇硕家呀?jīng)有了任職經(jīng)歷，所以得到重用，直接任命官職。

眾所周知，秦瓊武藝高超、勇冠三軍，在開朝過程中秦瓊可謂勞苦功高，比起程咬金功勞更大，但是凌煙閣排名中程咬金卻在秦瓊之上，最后程咬金獲封世襲國公，秦瓊卻只是一個普通國公。要知道，世襲國公的子孫后代能夠享受的福蔭豈是普通國公能比的?那么，為什么秦瓊會受到如此“不公平”的待遇呢?

顯慶元年(656年)八月，程咬金任蔥山道行軍大總管討伐西突厥阿史那賀魯。結(jié)果副總管王文度跟大先鋒蘇定方不合，王文度嫉妒蘇定方戰(zhàn)功卓越，便對程咬金宣稱自己有皇帝密旨，程咬金信以為真，對王文度所言是句句聽從，最后導(dǎo)致唐軍出兵西線勞師無功，還屠城恒篤城，造成非常惡劣影響。

秦瓊被封翼國公的時間與程咬金是同一年，史料記載秦瓊參與了玄武門之變，但其實(shí)秦瓊并未直接參與，沒有發(fā)揮重要作用，功勞遠(yuǎn)不如長孫無忌、尉遲敬德，甚至不如段志玄等人，這就制約了他后來的進(jìn)步。