一些學(xué)者認(rèn)為，尼西亞帝國(guó)的統(tǒng)治標(biāo)志著“希臘”民族和國(guó)家意識(shí)的興起;但是他們也指出，這種民族意識(shí)的興起并沒(méi)有對(duì)官方的“帝國(guó)”意識(shí)形態(tài)產(chǎn)生影響。傳統(tǒng)的看法(拜占庭帝國(guó)是羅馬帝國(guó)的繼承者)并未改變，這一點(diǎn)可以從尼西亞皇帝們的子民“Rhomaioi”的稱(chēng)呼中得以說(shuō)明。尼西亞帝國(guó)的官方意識(shí)形態(tài)是再征服運(yùn)動(dòng)和軍國(guó)主義(這些在14世紀(jì)后半期帕列奧列格王朝的修辭中就見(jiàn)不到了)，以君士坦丁堡的持續(xù)榮耀和光復(fù)君堡的希望為特征，強(qiáng)調(diào)君士坦丁堡類(lèi)似于舊約中上帝給予選民的“應(yīng)許之地”而不是訴諸于政治上的普世主義或希臘民族主義;這段時(shí)期的皇帝們被頻繁的比作摩西或所羅巴伯(巴比倫之囚后帶領(lǐng)猶太人回歸故土的領(lǐng)袖)，甚至是指引上帝子民去往應(yīng)許之地的“火柱”，如在一篇尼基塔斯-侯尼亞迪斯(尼西亞帝國(guó)時(shí)期的歷史學(xué)家)獻(xiàn)給塞奧多利一世的獻(xiàn)辭中中(表現(xiàn)的那樣)。

這期間的文辭也采用舊約之外的意象來(lái)贊美帝國(guó)的光復(fù)戰(zhàn)爭(zhēng);尼基塔斯-侯尼亞迪斯在對(duì)塞奧多利一世的頌詞中，把尼西亞帝國(guó)與塞爾柱蘇丹的戰(zhàn)斗描繪成基督教與伊斯蘭之間的戰(zhàn)爭(zhēng)(盡管這一戰(zhàn)斗中原來(lái)的拜占廷皇帝阿列克修斯三世在塞爾柱人一方參戰(zhàn))，并且把塞奧多利在手刃塞爾柱蘇丹的戰(zhàn)斗中所受的傷比做十字架上耶穌受的苦難。Dimter Angelov認(rèn)為西方十字軍的理念已經(jīng)影響了尼西亞的再征服運(yùn)動(dòng)，同一時(shí)期牧首Michael IV Autorelanos在戰(zhàn)斗前對(duì)尼西亞軍隊(duì)提供了全面的赦罪，這和西方十字軍全面赦罪很相像。但是這種可能受十字軍影響的赦罪行動(dòng)存在時(shí)間很短暫，1211年之后就漸漸消失。

十三世紀(jì)的拜占廷人也發(fā)現(xiàn)了(1204年之后)帝國(guó)的境遇和古典時(shí)期希臘的類(lèi)似之處，這加強(qiáng)了一些學(xué)者(如A.E.Vacalopoulos)的觀(guān)點(diǎn)，他們認(rèn)為這種類(lèi)比及對(duì)拜占庭”古典”的再評(píng)價(jià)，是希臘民族主義的起源。君士坦丁堡陷落后，帝國(guó)的境遇被認(rèn)為類(lèi)似于被野蠻人包圍的(古典時(shí)期)“希臘人”。侯尼亞迪斯就把塞奧多利殺死的塞爾柱蘇丹(凱庫(kù)斯老一世)比作薛西斯，牧首Germanus II (1223–1240)將約翰三世的勝利視作另一場(chǎng)馬拉松或薩拉米斯大捷。類(lèi)似的，塞奧多利二世則將他父親的勝利比作亞歷山大大帝的事跡，并且贊美了同時(shí)代“希臘人”的赫赫武功。

另外，在拜占庭人的語(yǔ)言中，這一時(shí)期“希臘人Hellene”一詞的意義似乎已經(jīng)有所改變。(自基督教成為國(guó)教)到這一時(shí)間點(diǎn)為止(十三世紀(jì)之前)，“希臘人”一詞指“異教”，是貶義詞(源出圣經(jīng))。而從尼西亞帝國(guó)時(shí)期開(kāi)始，“Graikoi”和“Hellenes”開(kāi)始作為宗教和民族的自我認(rèn)同形式，進(jìn)入帝國(guó)的外交用語(yǔ)中，反映了 將帝國(guó)及其子民同拉丁人區(qū)分開(kāi)的殷切期望。

牧首Gemanus II特別論證了這一新的民族和宗教身份。他在信件中將完美的出身等同于希臘血統(tǒng)的純潔，強(qiáng)調(diào)他希臘修辭和希臘民族背景重于與君士坦丁堡的關(guān)系，并蔑視那些沾沾自喜于竊取君士坦丁堡的拉丁人。(現(xiàn)在)學(xué)者還在爭(zhēng)論“希臘人”一詞含義轉(zhuǎn)移的確切時(shí)間，如Roderick Beaton認(rèn)為，十二世紀(jì)“希臘人”一詞的應(yīng)用，說(shuō)明這一詞匯的意義在1204年君士坦丁堡陷落前就已得到重新評(píng)估。此外，不像Vacalopoulos，Beaton認(rèn)為這一時(shí)期僅僅存在萌芽狀態(tài)的(希臘)民族意識(shí)，主要是基于語(yǔ)言認(rèn)同，還稱(chēng)不上希臘民族主義。

拜占廷學(xué)家安戈?duì)柕?Michael Angold)指出，這段時(shí)期帝國(guó)的意識(shí)形態(tài)變化，顯示出拜占庭人對(duì)于政治上的流亡、動(dòng)蕩和文化環(huán)境變化的適應(yīng)能力。但是帕列奧列格朝的米海爾八世光復(fù)帝國(guó)之后，拋棄了絕大部分尼西亞帝國(guó)發(fā)展的思想意識(shí)，帝國(guó)在思想上回到了早期狀態(tài)。